棉花3.1万公顷（2.6%）。
2012年，农业作物的种植面积为116.57万公顷，同比增长0.6%。其中，粮食作物种植面积为56.86万公顷，占农业种植总面积的48.8%；粮用豆类作物4.92万公顷（4.2%）；油料作物5.45万公顷（4.7%）；棉花3.1万公顷（2.6%）；烟草3400公顷（0.3%）；甜菜5600公顷（0.5%）；土豆8.16万公顷（7%）；蔬菜4.54万公顷（3.9%）；饲料作物31万公顷（26.6%）。
吉尔吉斯斯坦是中亚地区主要棉花种植国，也是世界上重要的产棉区，种植面积约3.1万公顷左右。
