按照你的描述，你妈在村里上的是城乡居民医疗保险，应该能使用，单位给你妈上的三险（农综险），只有大病能用。可能是信息重复了，系统自动默认后者。你打12333，让他们把你的医保信息改成城乡居民医疗保险就可以了。
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这个应该是有区别的，保险种类分为五险一金和三险，最低挡的保险都是三险核算标准；农村户籍保险应该是三险，要比城镇军民缴纳的保险基数要低，领取的费用也会少一些；主要原因是你上班的时候缴纳的基数也相对少。
给你举个例子：以下是五险一金的，三险一金的就是你的基数要低
如果你2020年退休，正常你的基础养老金是2019年的社会平均工资×20％，但是如果你在退休之前养老保险中断了30个月，就是中断了2.5年，按2年算，你的基础养老金就是2017年社会平均工资×20％
你是农民户口，本身就不能参加城镇职工养老保险，在参加工作的情况下，是可以按照城镇职工缴费的，但是你一旦失去了工作，也就失去了缴纳城镇职工养老保险的资格，是不能自己缴费的，所以，必须要找到工作才可以继续缴费，或者挂靠才可以。
