1、繁殖方法不同
月季扦插苗是通过扦插的技术来繁殖的，就是用植物的枝条、茎干、根部或者叶子作为插穗，将插穗插入苗床上，浇水，保持土壤湿润即可；月季实生苗通过种子播种的方法进行繁殖，覆土不能太深，用喷洒的方法浇水。
2、成活率不同
扦插苗的成活率不如原生苗好，因为扦插需要掌握一定的技巧，插穗选择、扦插的深度、环境等因素都会影响成活率；植物的种子在催芽后都很容易发芽，种植即能成活。
3、生长能力不同
扦插苗是二次生根，它的根系比较稀疏，主根弱，生长能力没有原生苗好；实生苗的根系很发达，生长速度也会更快。
4、品种纯度不同
大部分的扦插苗都能保持其母株的特性，苗子成活以后和母株有一样的外形，也能正常开花、结果；实生苗在繁殖过程中容易发生变异，影响开花和结果。
月季扦插苗和种子苗区别：
一是根系不同。扦插苗只有侧生根，没有主根系；实生苗有明显的主根。
二株型不同。扦插苗枝条没有主枝，都是侧芽，而实生苗有明显的主枝。
三是活性不同。扦插苗可快速繁殖，寿命较短，活性低于实生苗。
四是花期不同。扦插苗开花早，实生苗开花晚旧。
五是价格不同。扦插苗价格更实惠一些。
月季实生苗根茎粗大，扦插苗根须更值细长，
