一般来说容易生虫、生虫后比较难防治的果蔬，常常是农药污染比较严重的品种。如水果中的苹果、梨、李子、葡萄、草莓、西瓜、橘子、香蕉等农药残留比较严重，而带壳的水果如荔枝、龙眼等污染较小。污染较重的蔬菜有叶菜和细菜，如小白菜、青菜、鸡毛菜、韭菜、菠菜、油菜等，而根菜、瓜菜和果菜（如土豆、南瓜、黄瓜、苦瓜、西红柿、窝瓜以及洋葱等）受到农药的污染相对较小，并且这些蔬菜的营养成分也较高。
对于“买菜买有虫眼的没有农药”这一说法，其实没有科学道理。因为菜农喷药时很难做到同一时间内杀死全部害虫，时间长了，害虫会产生抗药性，当菜农再喷药时它们会逃开，随后再“杀将回来”。因此，蔬菜上留有虫眼未必就没有农药残留物。而且，蔬菜表皮有一层蜡质，能起到防止害虫和有毒物质侵害的作用。一旦蔬菜表皮受到损伤，各种细菌等病原微生物都会乘虚而入，不利于人体健康。
1、部分生物农药。比如苏云金杆菌、白僵菌，植物源提取的苦参碱等。
2、无机农药，比如石硫合剂、王铜、波尔多液之类。
3、活性高，使用剂量较少的农药。比如：氟硅唑、氟环唑等由于其活性高，使用剂量少，残留自然就低。
