南京航空航天大学（南航）和中国民航大学（东航）都是国内知名的民航院校，各有其优势，具体哪个更好考研需要根据个人情况和目标进行选择。以下是它们的一些比较：

学校层次和实力

南京航空航天大学：211工程院校，专业实力强，尤其在华东地区有较高声誉。学校与各大空管局、管理局、航空公司、机场有密切联系与合作，毕业生工作稳定，待遇不错。

中国民航大学：直属于中国民航局，民航院校的排头兵，专业丰富，特别是运行控制、机务维修等专业具有行业优势。学校与各大航空公司均有合作，对于技术性专业，本科生足以胜任，研究生如果本科不是学民航专业，建议学习技术性专业如签派、机务、情报等，这样毕业后不愁找工作。

考研难度

南京航空航天大学：研究生招生工作刚开始起步，报名人数不多，大部分是本校学生，比较容易考取。

中国民航大学：虽然东南大学的整体实力较强，但南航在江苏地区的考研难度相对较低，建议如果心态不好或者求稳也可以考南航，本校学生进复试后好好复习，被刷的可能性较小。

专业特色

南京航空航天大学：培养民航飞行员的摇篮，飞行专业具有较强竞争力，其他民航特殊专业也有比较优势。

中国民航大学：在运行控制、机务维修等专业具有行业优势，毕业生在就业市场上具有较高竞争力。

就业方向

南京航空航天大学：毕业生多进入行政单位和国有企业，工作稳定，待遇不错。

中国民航大学：毕业生在各大航空公司、机场、空管局等单位有广泛的就业机会，尤其是技术性专业毕业生需求较大。

建议

如果你对成为飞行员感兴趣，或者希望在民航系统内发展，南京航空航天大学是一个很好的选择。

如果你希望在民航领域从事技术性工作，如签派、机务、情报等，中国民航大学可能更适合你。

从考研难度来看，南京航空航天大学相对容易考取，适合求稳的考生。

如果你追求学校层次和知名度，且专业方向与东南大学的强项相符，可以考虑东南大学，但需注意其考研难度较高。

最终选择哪个学校，建议结合自己的兴趣、职业规划以及实际情况进行综合考虑。